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Glossar
 
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  • 1 fg
    1 Femtogramm = 10E−15 g
  • 1 µm
    1 um, eigentlich sollte es 1 µm (1 Mikrometer) heißen, 1/1.000.000 Meter und ist die gebräuchlichste Längeneinheit bei der Beschreibung von mikroskopischen Längen. Wegen der manchmal schwierigen Darstellung des griechischen Buchstabens "mü" oftmals stattdessen aber falsch durch "u" ersetzt.
     
  • 15189
    ISO15189 beschreibt die Anforderungen an die Qualität und Kompetenz für medizinische Prüflaboratorien.
  • 17025
    ISO-Norm 17025 beschreibt die Anforderungen an ein Prüf- und Kalibierlabor
  • 3'-Ende
    Bezeichnet Anfang bzw. das Ende eines Nukleotids bezogen auf die Syntheserichtung: Am 3'-Ende wird verlängert. Manchmal spricht man auch von Phosphat-Ende (5'-Ende) und OH-Ende (3'-Ende) und bezeichnet damit die chemische Gruppe, die am 5'-C-Atom der Desoxyribose bzw. am 3'-C-Atom der Desoxyribose befindet.
  • 5'-Ende
    Bezeichnet Anfang bzw. das Ende eines Nukleotids bezogen auf die Syntheserichtung: Am 3'-Ende wird verlängert. Manchmal spricht man auch von Phosphat-Ende (5'-Ende) und OH-Ende (3'-Ende) und bezeichnet damit die chemische Gruppe, die am 5'-C-Atom der Desoxyribose bzw. am 3'-C-Atom der Desoxyribose befindet
     
     
  • 5'-flaps-Primer
    Auch als "tailed" oder "überhängende" Primer bezeichnete PCR-Primer, die ein unspezifische Verlängerung am 5'-Ende tragen. Dadurch soll die real-time PCR effizienter verlaufen als nicht verlängert Oligonucleotide. 
  • 7-Töchter Evas
    Ein  von Bryan Sykes eingeführter Begriff, der die Abstammung der europäischen Linien von 7-Urtöchtern ausgehend von der afrikanischen Urmutter beschreibt. erstellt werden die Stämmbäume mittels mtDNA-Sequenzen der Hypervariablen Region
    Beispiel: Meine (JBF) mtDNA-Sequenz hat hohe Sequenz-Ähnlichkeiten mit der Gruppe "Die Bauern aus dem Osten", die aus dem Euphrat-Tigris-Gebiet die Landwirtschaft nach Europa gebracht haben.   
  • Absolute Quantifizierung
    Unter absoluter Quantifizierung versteht man in der qPCR die Bestimmung der Kopienzahl der Template-Moleküle meist mittels einer Standard-Kurve. Die Einheit kann  sein Template-Kopien, GU, Bakterien-Zahl, Zell-Zahl oder Virionen-Zahl etc.). Kritiker und Freunde der Digital-PCR bemerken hier zu Recht, dass es sich wegen der Rückführung auf einen Größenstandard dennoch nur um eine relative (zum Standard) Quantifizierung handelt.
     
  • Additive
    Sind Zusätze in der PCR, die das Aufschmelzen der Template-DNA (dsDNA) unterstützen, Inhibitoren neutralisieren, Polymerasen aktivieren, Primer-Bindung stabilisieren oder ähnliche Funktionen haben um das PCR zu verbessern
  • Agarose
    Poly-Zucker der ähnlich wie Gelatine nach erhitzen wieder zu einem Gel erstarren kann und eine netzartige Matrix bildet für die Auftrennung von DNA, RNA oder Proteinen benutzt wird.
  • Akzeptor-Sonde
    Im FRET-Sondensystem ist damit die zweite Sonde gemeint, die das Emissionslicht des 3'-Fluorophores der 1. Sonde (Donor) aufnimmt und sein eigenes Licht emittiert. 
     
  • Alignment
    Ausrichtung von zum Beispiel zwei oder mehreren (Multiple-Alignment) Sequenzen (DNA oder Aminosäure), um in einem Sequenzvergleich die Ähnlichkeit der Sequenzen aufzuzeigen.
     
  • Allel dropout
    Oder Allelic Dropout bezeichnet man den Ausfall eines Allels in der Analyse einer heterozygoten DNA, die Person erscheint dann homozygot was sie aber nicht ist. Ursache kann sein, dass ein Primer über einem Polymorphismus in der Primer-Bindesequenz liegt und damit garnicht oder sehr schlecht funktioniert.
     
  • allelic dropout
    Oder Allel Dropout bezeichnet man den Ausfall eines Allels in der Analyse einer heterozygoten DNA, die Person erscheint dann homozygot was sie aber nicht ist. Ursache kann sein, dass ein Primer über einem Polymorphismus in der Primer-Bindesequenz liegt und damit garnicht oder sehr schlecht funktioniert.
     
  • Alu-Element, Alu-PCR
    Alu-Elemente sind hochrepetitive DNA-Sequenzen (ca. 280 bp), die zu mehreren 10.000 fach in einem Genom vorkommen. Ein Alu-PCR könnte also hoch sensitiv gDNA nach weisen.
  • Ambulant erworbene Infektion
    Eine Krankheit welche außerhalb einer Institution erworben wurde.
  • Amoebe
    Amoeben, griech.: amoibe, zu deutsch "Wechsel"-Tierchen, was sich auf das wechselnde Erscheinungsbild der äusseren Form der Zellen bezieht. Typisch ihre fliessende Fortbewegung.
     
  • Amplifikations plot
    Auftrag der PCR-Produktmenge, meist als Fluoreszenzmenge gemessen, gegen die Zyklen.
     
  • Amplikon
    PCR-Produkt
  • Annealing-Temperatur
    Die Temperatur bei der fast 100 % der Primer an der Template-DNA binden können, meist ca.: 3 bis 6 °C niedriger als die Tm des Primers. 
  • Antibiotikum
    Biologischer Wirkstoff aus Stoffwechselprodukten von Kleinstlebewesen, der andere Mikroorganismen im Wachstum hemmt oder abtötet.
  • Arosol
    Ein Gas, welches flüssige oder feste Stoffe in feinst verteilter Form enthält. Mittels Aerosol können beim Einatmen giftige Substanzen oder Mikroorganismen die Lunge erreichen und in den menschlichen Organismus eindringen. Dies ist der Fall bei Legionellen, die sich kleinen Wassertröpfchen befinden und dann zusammen mit der Luft bis in die Lungenalveolen eindringen können.
  • Assay
    Assay (engl.), Test ein definiertes Nachweisverfahren zum qualitativen oder quantitativen Nachweis, biologischer Assay, Labor-Assay
  • Bakteriophage
    Meist kurz als Phagen bezeichnet, die sich in Bakterien als Wirtsorganismus vermehren. Bekannt im Labor sind Lambda-Phage oft als Größenstandard benutzt und die Gruppe der T7-Phagen aus denen machen Enzyme (T7-RNA-Polymerase) genutzt werden. 
  • Baseline
    Grundlinie ist eine Art Startlinie, die durch Normalisierung der Hintergrund-Fluoreszenz aller analysierten Proben entsteht. 
  • Baseline Setting
    Bezeichnet das Verfahren mit dem die Basislinie einer real-Time PCR gesetzt wird. Wichtig ist wie lange, d. h. über wieviele Cyclen die Werte der Grundfluoreszenz in die Normalisierung einbezogen werden, meist 10 bis 15 Cyclen.
     
  • Bestimmtheitsmaß
    Eine statistische Kenngröße, um die Korrelation von Modell-Kurve und Messwerte zu beschreiben. Bsp.: ein Bestimmtheitsmaß von 1 =100% für eine Standard-Gerade bedeutet alle Meßpunkte liegen auf der Regressionsgeraden.
  • Beta-Actin
    Früher häufig genutzt, um bei Northern-Blots (Hybridisierung DNA gegen RNA) den mengenmäßig gleichen Auftrag der mRNA in den einzelnen Spuren sichtbar zu machen. Bsp.: Gleiche Bandenintensität in der Hybridisierung gegen beta-Actin bedeutet gleiche RNA-Menge in dem Gel.
  • BHQ
    Black Hole Quencher

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