Bezeichnet Anfang bzw. das Ende eines Nukleotids bezogen auf die Syntheserichtung: Am 3'-Ende wird verlängert. Manchmal spricht man auch von Phosphat-Ende (5'-Ende) und OH-Ende (3'-Ende) und bezeichnet damit die chemische Gruppe, die am 5'-C-Atom der Desoxyribose bzw. am 3'-C-Atom der Desoxyribose befindet
 
 

Auch als "tailed" oder "überhängende" Primer bezeichnete PCR-Primer, die ein unspezifische Verlängerung am 5'-Ende tragen. Dadurch soll die real-time PCR effizienter verlaufen als nicht verlängert Oligonucleotide.