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Dark Quencher
Dark Quencher, dunkle Quencher, die kein Fluoreszenzlicht abgeben. auch bezeichnet als Non-Fluoreszenz Quencher (NFQ) oder Black hole Quencher (BHQ), wenn man den größeren, breitere Wellenlängenbereich bezeichnen möchte.
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dbSNP
dbSNP, steht für "Datenbank für SNPs" des Menschen und beinhaltet häufige und auch seltene SNPs (Single Nucleotide Polymorphismens) und SNVs Single Base Nucleotid Varianten, kleiner als 50 bp Deletionen und Insertions Polymorphismen und andere Varianten.
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DeltaCt
Delta = Differenz von Ct-Werten, drückt deltaCt das Verhältnis der Template-Mengen aus.
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DeltaDeltaCt
Drückt das Verhältnis Gene of Interest zu endogener Referenz von Proben aus (erstes Delta CT), und diese Verhältnisse einer behandelten Probe wird ins Verhältnis gesetzt zu einer unbehandelten Probe (zweites DeltaCt).
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Denaturierung
PCR-Schritt mit hoher Temperatur, 90 °C bis 98 °C, bei der die dsDNA einzelsträngig (denaturiert) gemacht wird. Im Gegensatz zu Proteinen ist die DNA-Denaturierung reversible, Einzelstränge können bei niedrigen Temperaturen wieder zu Doppelsträngen renaturieren.
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Dimere, PCR-Dimere
Mögliches Nebenprodukt einer PCR Reaktion bei der Primer einander amplifizieren und ein Produkt entstehen lassen.
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direkte RT-PCR
Reverse Transkription und PCR ohne (direkt) Isolation der RNA.
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DNA-Fingerprint
Besteht aus einer Anzahl an PCR-Produkten, polymorpher Marker, die nach einer Gelelektrophorese ein Fingerprint-ähnliches Bandenmuster zeigen. Polymorph bedeutet ein Marker kann in einer Population unterschiedlich lange Allele zeigen. daraus ergibt sich die Möglichkeit Individuen zu identifizieren.
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DNA-Helicase
DNA-Helicasen sind Enzyme der DNA-Replikation, Genregulation und Reparatur, die die Spiralisierung der dsDNA unter ATP-Verbrauch öffnen können.
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dNTPs
dNTPs: Abkürzung für Desoxynucleosidtriphosphate: Sammelbegriff für die im PCR benutzten vier Nucleotide dATP-Desoxyadenosintriphosphat, dGTP Desoxyguanosintriphosphat, dTTP Desoxythymidintriphosphat, dCTP Desoxycytosintriphosphat.
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Donor-Sonde
Im FRET-Sondensystem ist damit die erste Sonde gemeint, dessen 3'-Fluorophor das Anregungslicht des real-time Cyclers aufnimmt und sein Emissionslicht auf das 5'-Fluorophor der Akzeptor-Sonde überträgt.
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DQ
Dark Quencher
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Dye
Farbstoff (englisch), in der real-time PCR sind die Fluoreszenzfarbstoffe der Sonden oder der dsDNA-bindenden Farbstoffe gemeint.
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Dye Selection
Auswahl der Fluoreszenz-Farbstoffe bei der Planung oder dem Set up des real-Time PCR-Gerätes. Farbstoff (Dye). Quencher und Detektionskanal müssen zueinander passen.