Abgekürzt mit E, meist in Prozent angegebene Kennzahl, wie gut eine PCR amplifiziert, 100 % bedeutet eine vollständige Verdopplung pro Zyklus.

Werden zwei unterschiedliche PCR-Assays (mit unterschiedlichen Effizienzen) gemessen, müssen für eine vergleichende Quantifizierung die Effizienzen mit in den Vergleich einbezogen werden.

EIA, Abkz.: Enzyme Immuno Assay, immunologische-biochemische Bestimmung von Biomolekülen. Hochsensitives Verfahren bei dem der erkennenden Antikörper durch eine enzymatische Farbreaktion sichtbar gemacht wird, alternative Radio Immuno Assay, der erkennende Antikörper wird über Radioaktivität sichtbar gemacht.

Elongation oder Extension Step englisch, "Ausweitungs"-Schritt, bezeichnet den dritten Schritt eines PCRs in dem der Primer komplementär zum Template verlängert wird, also der eigentliche Kopierschritt. 

Eine Kontrolle (Zielsequenz), die in der Probe selbst enthalten ist, also nicht von aussen zugegeben werden muss.

In relativen Genexpressionsstudien werden endogene, in der Probe selbst enthaltene Zielsequenzen für die Normalisierung der RNA/cDNA-Kopienzahl genutzt. Es müssen also nicht Gene, sogenannte house keeping gene (HKG) sein, Alu-Elemente zum Beispiel tun es auch. Die Zielsequenzen müssen konstant und stabil sind bzgl. deren Expression in allen Zelltypen und Entwicklungszuständen unabhängig von der Behandlung der Proben.

Endpunkt Analyse, bezeichnet die Analyse eines PCR-Produkte am Ende der PCR-Cyclen im Gegensatz zur real-time PCR, die bereits während des Laufs Daten über den Anstieg der Amplikon-Menge anzeigt.
 

DNA-Sequenz meist einige Kbp vor dem eigentlichen Gen, das Bindestellen für Transcriptionsfaktoren enthält und so die Transcription des nachfolgenden Gens verstärken kann. 

Das gehäufte Auftreten einer Infektionskrankheit in einem begrenzten Gebiet und Zeitraum.

Eine Wissenschaft, die sich mit der Entstehung, Verbreitung und Bekämpfung, sowie den sozialen Folgen von Epidemien, zeittypischen Massenerkrankungen und Zivilisationsschäden befasst.
 

Ein grün fluoreszierender Farbstoff, der durch seine Bindestärke an Doppelstrang-DNA zum Nachweis von PCR-Produkt in der real-time PCR mit Schmelzkurven-Analyse genutzt wird.
 

Eine Kontrolle (Zielsequenz), die in das PCR (von aussen, exo-gen) z. B. in den Mastermix hinzugefügt wird.

Wird ermöglicht durch die Nutzung zweier Primer und der PCR-Kopien aus den früheren Zyklen die als Vorlage genutzt werden können. Damit ergibt sich die Menge PCR-Produkt als  2Exp35 bei der Template Molekülzahl 1 und 35 PCR-Zyklen.

Quantifiziert die RNA/cDNA-Menge eines oder mehrerer Gene in einer Probe im Verhältnis zueinander oder zu einer internen Referenz bestimmen (relative Quantifizierung) Bsp.: relativer Anstieg von HSP70 einer Hitzeschock behandelten Probe zu einer unbehandelten Probe.

Extension Step englisch, "Ausweitungs"-Schritt, Elongation, bezeichnet den dritten Schritt eines PCRs in dem der Primer komplementär zum Template verlängert wird, also der eigentliche Kopierschritt.