Wissensdatenbank - Glossar

• dNTPs
  dNTPs: Abkürzung für Desoxynucleosidtriphosphate: Sammelbegriff für die im PCR benutzten vier Nucleotide dATP-Desoxyadenosintriphosphat, dGTP Desoxyguanosintriphosphat, dTTP Desoxythymidintriphosphat, dCTP Desoxycytosintriphosphat. 
   
• DNA-Helicase
  DNA-Helicasen sind Enzyme der DNA-Replikation, Genregulation und Reparatur, die die Spiralisierung der dsDNA unter ATP-Verbrauch öffnen können.
   
• Donor-Sonde
  Im FRET-Sondensystem ist damit die erste Sonde gemeint, dessen 3'-Fluorophor das Anregungslicht des real-time Cyclers aufnimmt und sein Emissionslicht auf das 5'-Fluorophor der Akzeptor-Sonde überträgt.
   
   
• Dye
  Farbstoff (englisch), in der real-time PCR sind die Fluoreszenzfarbstoffe der Sonden oder der dsDNA-bindenden Farbstoffe gemeint.
• Dark Quencher
  Dark Quencher, dunkle Quencher, die kein Fluoreszenzlicht abgeben. auch bezeichnet als Non-Fluoreszenz Quencher (NFQ) oder Black hole Quencher (BHQ), wenn man den größeren, breitere Wellenlängenbereich bezeichnen möchte.
• DQ
  Dark Quencher
• dbSNP
  dbSNP, steht für "Datenbank für SNPs" des Menschen und beinhaltet häufige und auch seltene SNPs (Single Nucleotide Polymorphismens) und SNVs Single Base Nucleotid Varianten, kleiner als 50 bp Deletionen und Insertions Polymorphismen und andere Varianten. 
• Dye Selection
  Auswahl der Fluoreszenz-Farbstoffe bei der Planung oder dem Set up des real-Time PCR-Gerätes. Farbstoff (Dye). Quencher und Detektionskanal müssen zueinander passen.
• Denaturierung
  PCR-Schritt mit hoher Temperatur, 90 °C bis 98 °C, bei der die dsDNA einzelsträngig (denaturiert) gemacht wird. Im Gegensatz zu Proteinen ist die DNA-Denaturierung reversible, Einzelstränge können bei niedrigen Temperaturen wieder zu Doppelsträngen renaturieren.
• DNA-Fingerprint
  Besteht aus einer Anzahl an PCR-Produkten, polymorpher Marker, die nach einer Gelelektrophorese ein Fingerprint-ähnliches Bandenmuster zeigen. Polymorph bedeutet ein Marker kann in einer Population unterschiedlich lange Allele zeigen. daraus ergibt sich die Möglichkeit Individuen zu identifizieren. 
• DeltaCt
  Delta = Differenz von Ct-Werten, drückt deltaCt das Verhältnis der Template-Mengen aus.
• Dimere, PCR-Dimere
  Mögliches Nebenprodukt einer PCR Reaktion bei der Primer einander amplifizieren und ein Produkt entstehen lassen.
• direkte RT-PCR
  Reverse Transkription und PCR ohne (direkt) Isolation der RNA.
• DeltaDeltaCt
  Drückt das Verhältnis Gene of Interest zu endogener Referenz von Proben aus (erstes Delta CT), und diese Verhältnisse einer behandelten Probe wird ins Verhältnis gesetzt zu einer unbehandelten Probe (zweites DeltaCt).