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Step
Als Schritt oder Step werden bei manchen Cycler die einzelnen Denaturierungsschritte, Annealingschritte oder Extensionschritte bezeichnet.
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STR
Steht für
Short
Tandem
Repeat, kurze= short, hintereinander liegende, Sequenzwiederholungen=Repeats. Beispiel:
csf1po.jpg (524×510) (nist.gov).
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strikt
strikt aerob, [griech: ] engl.: strict aerobic, Sauerstoff genötigend, bezeichnet Zellen, die nicht ohne die Anwesenheit von Sauerstoff leben/wachsen können, alternative ist fakultativ anaerob sie können müssen aber nicht ohne Sauerstoff leben.
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Superprimer
Besonders lange Primer mit >60 nt und bis zu 200 nt Länge, diese sollen zu deutlich kleineren Ct-Werten führen.
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SYBR-Green
Ist ein Doppelstrang-DNA-bindender Farbstoff, der genutzt wird, um die Menge PCR-Produkt in einer real-time PCR zu messen und über eine Schmelzkurvenanalyse Informationen über die Basenzusammensetzung des Amplikons zu erhalten.
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Taq
Laborjargon "die Taq", für Taq-Polymerase hitzestabile DNA-Polymerase isoliert aus Thermus aquaticus, zentrales Enzym der Polymerase-Kettenreaktion (PCR).
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Taq-Polymerase
Taq-Polymerase hitzestabile DNA-Polymerase isoliert aus Thermus aquaticus, zentrales Enzym der Polymerase-Kettenreaktion (PCR).
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Taqman-Sonde
Taqman-Sonde auch als Hydrolysis-Sonde bezeichnet, zeigt nach Bindung an der Ziel-DNA-Sequenz durch Hydrolyse der Sonde mit Hilfe der Taq-Polymerase (bei 60 °C) eine Fluoreszenz-Emission.
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Temperatur-Zeit-Profil
Beschreibt die Temperatur in °C und Zeitdauer in Sekunden der einzelnen PCR-Schritte nebst der Anzahl Zyklen
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Template
Template englisch und deutsch, bedeutet Vorlage oder Matrize und bezeichnet die Ausgangs-DNA als Vorlage für die PCR-Amplifikation.
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Template-Menge
DNA-Ausgangsmenge eines PCRs, Einheit: Zahl der Kopien von Template-Molekülen zu Beginn der PCR, meist als No bezeichnet.
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Thermocycler
Maschine, die die PCR erlaubt durch die Ausführung des Temperatur-Zeit-Profils als Programm
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Threshold
Threshold (englisch), Schwelle (deutsch) ist eine Hilfslinie, die in einem Fluoreszenz versus Cyclus Graph gezogen wird, um einen Ct-, Cot- oder Cq-Wert zu ermitteln. Durch die Hilfslinie können verschiedene Proben über den gleichen Fluoreszenz-Wert verglichen werden, sodass die unterschiedlichen Template-Menge durch die unterschiedlichen Ct-Werte ausgedrückt werden können.
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Threshold Setting
Bezeichnet das Verfahren mit dem der Threshold, Schwellenwert, festgelegt wird. Unterschiedliche Geräte, Analyse-Programme und Fragestellungen des Exprimentes haben unterschiedliche Regeln den Threshod zu setzen.
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Topoisomerase
Topoisomerasen sind Enzyme der DNA-Replikation, die die Verdrilllung (Topologie) der DNA regulieren. Sie können, entweder einen Strang oder beide Stränge aufschneiden, die DNA entdrillt sich und die Stränge wieder verbinden.
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Troubleshooting
Troubleshooting (engl.), Fehlerbeseitigung: ein Verfahren nicht nur bei Laborarbeiten, bei dem man systematisch an der Beseitigung und dem Auftreten von methodischen Fehlern arbeitet.
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unbekapselt
unbekapselt, engl.: non-encapsulated, bei der Färbung von Bakterien ist eine Kapsel um die Zellwand der Bakterien nicht sichtbar, Kapseln sind extrem dicke Zuckeransammlungen aussen auf der Zellwand, die das Bakterium schützen.
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VNTR
Variable Number of Tandem Repeats, länger als STR-Marker 33 bp bis mehere 100 bp.
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Wasser
Wasser besser Wasser für die Molekularbiologie, DNA-, DNase- und RNase-freies destilliertes oder entsalzenes Wasser.
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Zyklus
Die sich wiederholende Gesamtheit aus Denaturierung, Annealing und Extension wird als Zyklus bezeichnet.
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Zyste
Zyste, engl.: cyste, Dauerform von einzelligen Lebewesen, hier von Amoeben