Der Graph Fluoreszenz gegen PCR-Cyclus zeigt den Anstieg der Fluoreszenz über die Zeit (Cyclus). Auf der Y-Achse sind die Fluoreszenz-Messwerte aufgetragen, die ein Maß für die Amplifikation von PCR Produkt darstellen, auf der X-Achse der Cyclus. Die Basislinie stellt die Normalisierung der Hintergrundfluoreszenz dar, der Threshold ist eine Hilfslinie, um den Ct-Wert zu bestimmen. Schattiert sind die einzelnen Phasen der Amplifikation.