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Primer-Design ohne SNPs unter Primern
Bei den Primer3Plus Einstellungen (Advanced Setting) gibt es die Möglichkeit, dass das Programm Ns ignorieren, oder akzeptieren soll. Damit können sie ausschließen, dass Primer über SNPs...
7 Feb., 2020
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Sequenzier-Gel sparen ....
Lineares Polyacrylamid für die Kapillar-Gelelekrophorese ist einer der teuersten Komponenten beim Sequenzieren. Schön wäre es doch, wenn man die Gelreste, die die Maschine nicht mehr nutzen kann...
7 Feb., 2020
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DNA-Präparation aus Spurenträgern
Als wir noch Spurenanalysen machten ... hatten wir oftmals sehr dreckige Spurenträger mit allerhand Dreck und Staubpartikel. Um die Probe dennoch sauber zu bekommen, haben wir zunächst lysiert,...
7 Feb., 2020
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Ligationen in Glaskapillaren
Bei Ligationen (vor den Kit-Zeiten) hat man versucht die Konzentration der DNA zu erhöhen, indem man in einem sehr kleinen Volumen gearbeitet hat. Um zu verhindern, dass zuviel Flüssigkeit...
7 Feb., 2020
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"Als man noch mit dem Mund pipettiert hat"
Mein Doktorvater hatte Restriktionsenzyme immer mit einer Glaskapillare und einem kleinen Gummischläuchchen pipettiert, so konnte er auch geringe Volumina genau pipettieren, besonders wenn die...
7 Feb., 2020
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Dimere und SYBR-Green & Eva-Green im real-time PCR Assay
Dimere entstehen durch Annealing von Primern an Primern und Amplifikation zu einem Primer-Dimer. Die Stabilität der Primer-Primer-Bindung hängt von der Temperatur (Annealing), Basenzusammensetzung...
7 Feb., 2020
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Chloroform tropft beim pipettieren
Bekanntlich tropft es beim Pipettieren von Chloroform und anderen Flüssigkeiten mit .... ja richtig einem hohen Dampfdruck. Die Lösung ist, pipettieren Sie 4 bis 5 mal in der Chloroformlösung auf...
7 Feb., 2020
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Scheren von gDNA kann die PCR verbessern
Eine DNA-Präparation aus intakten Zellen (Blut/Zellkultur/Gewebe) führt meist zu langer gDNA (>150 kbp) das war perfekt für die alten Zeiten mit Southern-Blot und Hybridisierung, aber für PCR ist...
7 Feb., 2020
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CHD-W und CHD-Z-Amplikone auf Polyacrylamid-Gel.
Abbildung: Polyacrylamid-Gelelektrophorese von CHD-Amplikonen. Zu sehen sind: der Größenstandard (SD) 300, 400 bp ganz links aufgetragen, dann folgend die Proben. Mit Z-Bande und W-Bande sind...
13 Jan., 2020
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Schmelzkurve Auswertung (Sexing)
Abbildung: Genotypisierung mittels Schmelzkurve. Gezeigt ist die Schmelzkurven-Analyse mit Genoytypisierung auf einem MIC mit der Kurve für den ZZ-Genotyp (männliches Tier rote Kurve) und dem...
13 Jan., 2020
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Schmelzkurve Rohdaten - Sexing
Abbildung: Eva-Green-Schmelzkurve des CHD-PCR-Produktes von Tauben. Der Fluoreszenz-Temperatur-Graph zeigt eine Kurve mit zwei Wendepunkten, die auf zwei PCR-Produkte hinweisen, einmal das...
13 Jan., 2020
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Vergleichende Untersuchung zu Legionellentests
Bernd Stenger (2011). Zusammenstellung und Vergleich publizierter Legionellentests im Hinblick auf ausgewählte Validierungsparameter. Bachelor-Arbeit 2011.
13 Jan., 2020
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Sexing an Tauben
Molekularbiologisches Sexing an Tauben-Federn. Praktikumsarbeit 2019. Sarah Rudy
13 Jan., 2020
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pDRAW32
Zeichenprogramm für die Dokumentation und Unterstützung zur Planung von Klonierungsexperimenten. Wir benutzen es gerne für die Dokumenation unserer PCR-Amplione mit Exon-Intron-Beschriftung...
13 Jan., 2020
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Das Programm mit dem man Karyogramme zeichnen kann
Hiller B, Bradtke J, Balz H and Rieder H (2004):"CyDAS: a cytogenetic data analysis system", BioInformatics 2005 21(7):1282-1283; doi:10.1093/bioinformatics/bti146. http://www.cydas.org/index.html...
13 Jan., 2020
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mt-DNA-Sequenzen von echtem und wildem Hausschwamm
Jessica Rogatzki (2013). Vergleichende Sequenzanalyse des mitochondrialen Genoms von Serpula himantioides und Serpula lacrymans Als Schülerin eine ganz tolle Arbeit abgegeben.
13 Jan., 2020
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Ins-Dels oder Dip-Marker und frei circulierende DNA
Lara Ewert (2019). Anwendung von Insertions-/DeletionsPolymorphismen für die Typisierung von zirkulierender zellfreier DNA (ccf-DNA). Bachelor-Arbeit.
13 Jan., 2020
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real Time PCR Raucher gegen Nicht-Raucher
Laura Schnöder (2011). Aufbau eines Demonstrationsversuchs zum Nachweis unterschiedlicher Genexpressionen in Mundschleimhautzellen von Rauchern und Nichtrauchern. Bericht zur Praxisphase WS10/11.
13 Jan., 2020
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Standard-Additionsverfahren in der qPCR.
Marie-Christine Fuchs (2016). Quantitativer Legionellennachweis in Wasserproben: Standard-Additionsverfahren und Unterscheidung lebender und toter Legionellen. Masterarbeit 2016.
13 Jan., 2020
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ITS1 und ITS2-Amplikone
Der gelungene Versuch die ITS1- und ITS2-Amplikone zur Identifizierung von Pilzen zu nutzen. Marie-Christine Fuchs (2014). Studie über Längenpolymorphismen der Internal Transcribed Spacer...
13 Jan., 2020
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Eva-Green
Fei Mao, Wai-Yee Leung and Xing Xin (2007). Characterization of EvaGreen and the implication of its physicochemical properties for qPCR applications BMC Biotechnology 7, 76. Link
13 Jan., 2020
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cDNA und gDNA GAPDH
Abbildung: Datenblatt der GAPDH Primer-Positionen und Länge der Amplikone an cDNA von GAPDH und gDNA, aus Schnöder 2011. Die Abbildung wurde mit pDRAW32 erstellt und zeigt die...
9 Jan., 2020
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Typisierung mittels Restriktionsspaltung
Kann genutzt werden, um Pilze mittels unterschiedliche Sequenzen über Restriktions-Spaltungen zu identifizieren.
29 Dez., 2019
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rDNA-Operon
Die internal Transcript-Spacer Sequenzen (ITS1, ITS2) im rDNA-Operon sind nur gering konserviert zwischen verschiedenen Arten und können damit zur Identifizierung genutzt werden. Anders als...
28 Dez., 2019
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Schmelzkurve
Schmelzkurven von Serpula lacrymans in blau, und Serpula himantioides, rot, zeigen einen kleinen Unterschied zwischen beiden Arten. Die Sequenz des ITS1-ITS2-Amplikons unterscheidet sich in nur...
28 Dez., 2019
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