Die Abbildung zeigt den Energie-Transfer im Fluoreszenz-Prozess. Die Energie des Anregungslichts (kurzwellig) wird vom Fluorophor absorbiert, damit steigt sein Energiewert, die Elektronen erreichen höhere Energiestufen, die durch die Pfeile symbolisiert sind. Die Emmissions-Energie wird an den Quencher abgegeben und dort umgewandelt in Licht einer anderen Wellenlänge oder Wärme. Die Emission von Wärme kommt einer Auslöschung der gleich es erscheint keine Lichtemission.