Wissensdatenbank - Glossar

• PCR
  PCR engl. steht für polymerase chain reaction. Die Polymerase Kettenreaktion ist eine biochemische Methode, die mit Hilfe einer hitzestabilen Polymerase und zwei Sequenz-spezifischen Primern aus einer Mischung an DNA-Fragment ein spezifisches Zielfragment herausamplifizieren (vermehren) kann, um genügend Material für weitere Analysen zu erhalten.
• Primer
  Primer englisch, deutsch Starter, sind kurze einzelsträngige Oligonucleotide, die als spezifische Startpunkte für den Beginn der Replikation durch eine DNA-Polymerase oder die Umschreibung von RNA in cDNA durch eine Reverse Transcriptase in der Bioanalytik dienen (PCR).
   
• Puffer
  Puffer sind Mischungen aus einer Säure und einer Base, die einen stabilen pH Wert für biochemische Reaktionen sicherstellen.
• Probes
  Probes englisch zu deutsch Sonden, sind Oligonucleotide von ca.: 15 bis 35 nt Länge, die aufgrund ihrer Sequenz und Länge spezifisch eine DNA oder RNA-Zielsequenz binden können. Die Bindung an seine Zielsequenz ist mit einer Modifikation eines Fluoreszenzsignals verknüpft und kann zur Quantifizierung des PCR-Produktes, respektive PCR-Templates genutzt werden. Die Art der Modifikation hängt von dem Sondentyp ab. 
   
• Primer-BLAST
  Freies Online-Tool für Primer-Design und die Primer-Überprüfung auf Spezifität von NCBI, das Primer3 und BLAST nutzt.
• PCR-Gerät
  Maschine, die die PCR erlaubt durch die Ausführung des Temperatur-Zeit-Profils als Programm
• Probe
  Englisch für Sonde
• Produktmenge
  In der PCR-Formel meist mit Nn oder Nct bezeichnete Menge Amplikon, die nach einem bestimmten, n-ten Zyklus entsteht.
   
• Pool-Mix
  Bezeichnet das Vielfache an Master-Mix+Primer in Abhängigkeit von der Anzahl Proben, die man in einem Lauf analysieren möchte. Beispiel: 5 Proben 5,5-fach Pool (0,5 fache Zugabe wegen des zu erwartenden Pipettierfehlers). 
• Primer3/Primer3Plus
  Online Primer-Design Software: Primer3Plus
• Polymorphismus
  Beschreibt Varianten (Allele) in einer DNA/RNA-Sequenz, die keine klinische Auswirkungen haben: z. B. Haarfarbe oder Augenfarbe oder neutrale Basensubstitution G->A ohne Änderung der Aminosequenz.
• Primer-Check
  Online Tool für die Analyse von Primern bzgl. der Exon-Intron-Struktur nebst Splice-Varianten: Primer-Check
• Photometer
  Optisches Gerät zur Messung der Absorbtion von Licht unterschiedlicher Wellenlänge durch eine Probe. Bsp.: Nucleinsäuren absorbieren bei 260 [nm] und können dadurch quantifiziert werden
• Pseudogen
  DNA-Fragment einem Gen in Sequenz und Struktur ähnlich (Exon-Intron-Struktur), aber durch Mutationen inaktiviert. Bsp.: Aldolase A, B, C und Pseudogen, GAPDh und Beta-Actin treten mit einigen Pseudogenen auf.
• Prozessiertes Pseudogen
  Ein Pseudogen, dass in seiner Struktur einer cDNA  gleich kommt, also ohne Exon-Intron-Struktur. Bsp.: ACTBP1 und weiter ca.: 20 Pseudogene
• Pathogen
  Pathogen: Krankheiten verursachend.
• PCR(2)
  PCR, Abkürzung für Polymerase Ketten Reaktion, engl.: polymerase chain reaction, ein biochemisches Verfahren mit dem bestimmte DNA-Fragmente für eine bessere Analyse vermehrt werden
• pH
  pH-Wert, (pondus hydrogenii, Gewicht des Wasserstoff in einer Lösung). Zahlenmäßige Beschreibung des Säurewertes oder Laugenwertes  einer Flüssigkeit.
• Protozoen
  Protozoen, Einzeller mit Zellkern